Компания НТ-СПб, входящая в группу компаний НТ, официально зарегистрирована 20 мая 2003 года в г. Санкт-Петербурге. Однако она отсчитывает свою историю с середины 80-х годов прошлого века с момента начала исследований в области сканирующей туннельной микроскопии и спектроскопии в Институте аналитического приборостроения АНСССР. Эти исследования были начаты в ИАП АНСССР по инициативе к.ф-м.н. А.О.Голубка еще до присуждения Нобелевской премии Г. Биннигу и Г. Рореру, когда не выпускались серийные приборы, а физики во всем мире увлеченно создавали лабораторные СТМ, с помощью которых получали удивительно красивые результаты. Вместе с тем, специалисты понимали, что возник и активно развивается новый сегмент на рынке наукоемких приборов. Вскоре группа была реорганизована в лабораторию СТМ — первую лабораторию в Академии наук, деятельность которой была целиком посвящена этой проблеме. В середине 80-х был разработали воздушный СТМ, с контроллером связи с РС на базе КАМАК. В конце 80-х годов нами был разработан криогенный туннельный микроскоп — спектрометр, на котором были получены интересные результаты. Для совмещения СТМ и РЭМ нами был использован пьезоинерциальный принцип перемещения. В течение нескольких лет был выпущен целый ряд приборов, в числе которых были сверхвысоковакуумный, воздушный и низкотемпературный приборы, для институтов Москвы, Ленинграда, Харькова, Горького, Владивостока. В начале 2000-х, совместно с ЗАО «НТ-МДТ», была предложена концепция СЗМ для использования в университетах в образовательном процессе в области нанотехнологий. В мае 2003 года организован Санкт-Петербургский филиал ЗАО «НТ-МДТ» — ООО «НТ-СПб». В результате деятельности филиала появилась приборная платформа учебных СЗМ “NanoEducator”.